UEFA từng cấm 13 CLB tham dự Europa League vì dàn xếp tỷ số và vi phạm tài chính, trong đó Skenderbeu và AC Milan nhận án phạt nghiêm trọng nhất.
Liên đoàn Bóng đá châu Âu (UEFA) đã nhiều lần đưa ra các biện pháp kỷ luật cứng rắn đối với 13 câu lạc bộ bị phát hiện vi phạm nghiêm trọng các quy định trong khuôn khổ Europa League. Những án phạt này bao gồm lệnh cấm hoặc đình chỉ thi đấu, xuất phát từ các hành vi như dàn xếp tỷ số, vi phạm Luật Công bằng Tài chính (FFP), nợ chưa thanh toán hoặc sử dụng cầu thủ không đủ điều kiện.
Một trong những trường hợp bị xử phạt nặng nề nhất là CLB Skenderbeu của Albania, đội bóng này bị cấm tham gia mọi giải đấu do UEFA tổ chức, bao gồm cả Europa League, trong vòng 10 năm. Đồng thời, họ phải nộp phạt 1 triệu euro. Tòa án Trọng tài Thể thao (CAS) sau đó cũng giữ nguyên phán quyết của UEFA, khi xác định rõ Skenderbeu có hành vi dàn xếp tỷ số ở cả đấu trường quốc nội lẫn châu Âu.
AC Milan – một trong những ông lớn của bóng đá Ý – cũng bị loại khỏi Europa League mùa giải 2019/20 do vi phạm các quy định của FFP. Tuyên bố từ CAS nêu rõ: “AC Milan bị loại khỏi các giải đấu cấp CLB của UEFA trong mùa giải 2019-2020.” CLB này sau đó đã chấp nhận án phạt mà không kháng cáo.
Tại Thổ Nhĩ Kỳ, hai đội bóng lớn là Besiktas và Fenerbahce bị cấm thi đấu vì liên quan đến các vụ dàn xếp tỷ số trong nước. Trong khi đó, Malaga của Tây Ban Nha bị loại do không thanh toán các khoản nợ tài chính đúng hạn. FC Sion (Thụy Sĩ) bị cấm dự Europa League 2011/12 vì đăng ký cầu thủ không hợp lệ trong thời gian bị cấm chuyển nhượng.
Ngoài ra, nhiều đội bóng khác như Partizan Belgrade (Serbia), Rangers (Scotland), Rapid Bucharest và Steaua Bucharest (Romania), Dnipro (Ukraine), Inter Baku (Azerbaijan) và Targu Mures (Romania) cũng bị UEFA trừng phạt do các vi phạm liên quan đến tài chính hoặc quy chế thi đấu.
Tùy vào từng thời điểm và điều kiện đủ điều kiện tham dự, một số lệnh cấm của UEFA áp dụng đồng thời cho cả hai đấu trường: Champions League và Europa League.
